虽然已经有了历时较长的评估和较为畅通的环保人士、公众诉诸意见的渠道，但香港可持续发展研究中心的专家廖明廷和朱兆麟认为还不够。他们说，在台湾，环保团体和当地居民也被邀请参与现场勘察，保障透明性的同时也可采纳多方意见。反观香港，虽然环评报告提交后会有一个月的公众咨询期，但环评报告仅摘要为中文，其余部分都为英文，不利于普罗大众的理解。
环评报告逐个罗列第三跑道对各领域的影响，除了生态环境外，对当地居民的影响也值得关注。
大屿山人口较少，临近机场共有346间村屋和一间幼稚园，环评报告指第三跑道投入使用后，飞机噪音会向北面扩展，居民听到的飞机噪音约为55至60分贝，对学习和生活不会造成显著影响。报告还建议，第三跑道全面启用后，最靠近大屿山居民区的南跑道夜间将转为备用，这意味着三跑道系统比现时的双跑道更“低频环保”。
第三跑道环境评估报告对居民影响落墨很多，似在避免4年前港珠澳大桥“环评悲剧”的重现。
2009年7月，港珠澳大桥环评报告公布，同年12月15日内地工程正式开工。但半路杀出个程咬金，66岁的大屿山居民朱绮华女士于2010年1月向香港高等法院提出司法复核，质疑环评报告的完整性和真实性，特别是空气质量指标中未提及的污染物，包括臭氧、二氧化硫及悬浮颗粒。2011年4月，高等法院判决环境署署长败诉，指环评报告未比较大桥建成前后空气污染程度的变化，撤销已批发的环境许可证。港珠澳大桥香港段工程被迫停工8个月。
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