根据公开信息显示，海航航空股份有限公司持有祥鹏航空70.19%的股份，认缴245380.000439万元。云南鹏夏元昊投资合伙企业（有限合伙）持有祥鹏航16.49%股份。
云南省交通投资建设集团有限公司则持有13.32%股份，认缴出资46558.80976万元。
此外，海航在祥鹏亦有人事布局，其中云南祥鹏航空有限责任公司的董事长蒲明是前海航副总裁，现在还是西部航空有限责任公司董事长。
祥鹏航空成立于2004年7月，枢纽机场是昆明长水国际机场和丽江三义国际机场。重点机场是武汉天河国际机场和成都双流国际机场。截止2019年9月，祥鹏航空公司共拥有57架客机，其中包括3架空客A319-100、8架空客A320-200、6架A320neo、4架空客A330-300、12架波音737-700、21架波音737-800和3架波音737 MAX 8（处于停飞状态）。
2008年，云南省国资委和海航集团签署战略合作协议，双方共建祥鹏航空。2016年，祥鹏航空正式转型为低成本航空公司，这也是云南省第一个低成本航空公司。2016年8月2日，祥鹏航空正式获得国际航空运输协会（IATA）会员证书，成为国际航协正式会员。2017年4月10日，祥鹏航空引进了首架空客A330，成为大陆地区首个拥有宽体客机的低成本航空公司。
祥鹏航空还是U-FLY联盟成员，U-FLY联盟是全世界第一个低成本运营商联盟，成立于2016年1月，联盟成员包括香港快运航空、祥鹏航空公司、乌鲁木齐航空、西部航空和易斯达航空。
