网络战争和网络安全
然而，传感器的融合，暗示第六代喷气机将严重依赖数据链接和网络，这些网络可能会被干扰甚至通过黑客入侵而中断。陆基后勤网络，如F-35的ALIS，承诺将显著提高效率，但也会使着陆飞机面临潜在的网络攻击。
因此，第六代航空电子系统不仅必须针对对抗电子和网络战争的恢复能力而设计，而且可能能够对敌人发动这种攻击。例如，空军已经成功测试了入侵网络和插入数据包(如病毒)的能力，这是海军战斗机携带的下一代干扰机的能力。
人工智能
其中一个问题是，所有这些传感器、通信和武器系统都变得如此复杂，以至于它们有可能超过人脑的任务处理能力——记住，飞行员还必须驾驶飞机!虽然一些第四代战斗机配备了后座武器系统军官来协助作战，但第五代隐形战斗机都是单座飞机。
因此，空军正求助于人工智能来处理战斗机管理的更平凡任务，并决定向飞行员提供哪些数据。此外，人工智能和机器学习可以用来协调无人机。
无人驾驶飞机和无人机群
2016年10月，两架FA-18超级大黄蜂在中国湖上空部署了103架Perdix无人机。在人工智能的驱动下，无人机像蝗虫的云朵一样在指定的目标点上迅速降落。神风敢死队无人机已经投入使用，很容易看出相对较小和廉价的无人机如何能成为一种特别可怕的武器。
未来战争的理论家们认为，与为数不多的昂贵且防护良好的武器平台和导弹相比，廉价且可消耗的网络无人机要更难防御。然而，第六代战斗机可能也会使用更大、更快、更花哨的无人机作为携带传感器的侦察兵、武器平台和诱饵。
定向能武器
成群结队的无人机、导弹，甚至是过时的喷气式战斗机，都有可能使先进隐形飞机的进攻和防御能力饱和。一种常用的对策可能是定向能武器(露珠)，如激光或微波，它可以快速、精确地发射，并在有足够电力的情况下具有无限的弹匣容量。
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