4月3日，民航阿克苏运行办接到两起有关风切变引起的航班不正常事件报告，派相关专业监察员立刻前往空管站进行调查了解。
据调查，3月29日08:55，GCR6555使用27号跑道盲降进近过程中，下降到场高400英尺时，机组报告塔台飞机遭遇风切变，随后复飞，重新进近，于09:06正常落地，事发时地面AWOS显示风向风速为30002。4月2日20:35，CSN6869使用27号跑道盲降进近，在从场高1200米下降到场高600米过程中，机组报告遭遇严重风切变，请求上升高度到标准气压3600米，塔台同意，后该航班返航乌鲁木齐，事发时地面AWOS显示风向风速为29006。
调查中，运行办要求空管站和相关机场应持续落实管理局《关于加强运行和保障工作的紧急通知》（新疆局发明电【2015】231号）和运行办《关于做好春夏季大风、浮尘天气下安全运行的通知》（新疆局阿办发明电【2015】6号）的要求，尤其是管制、气象人员，在发现不正常天气时应及时向机组发出告警；同时，在接到机组报告不正常天气后，将相关信息及时传递给其他机组，使其早知道、早预判、早准备，降低因风切变导致的航班运行风险。
