美国联邦航空管理局（Federal Aviation Administration，简称“FAA”）和各航空公司组织大肆抨击欧盟做出的从明年起将航空业纳入排放交易体系的决定，认为此举超出了欧盟的监管权限并将剥夺各航空公司的利润，而各航空公司本可用这笔资金投资开发协助降低二氧化碳排放的新技术。
联邦航空局主管政策、国际事务和环境问题的副局长Julie Oettinger 周三在弗吉尼亚州阿灵顿召开的第四届ATW 生态航空年会上表示，“二氧化碳排放是一个需要全世界共同解决的全球性问题……欧盟继续单方面推行，我担心将各航空公司纳入欧盟排放交易计划]只会适得其反。减少航空业二氧化碳排放]需要全球采取共同策略。” 美国航空运输协会主管美国环境事务的总经理Timothy Pohle 补充表示，“你们所讨论的系统是深入其他国家攫取[航空公司]资金并以无法解决环境问题的方式使用这种资本……这项计划的确使用我们的资金购买旨在减少航空业二氧化碳足迹的新技术。” 航空运输协会及其三家成员航空公司— 美国航空、大陆航空和联合航空— 于2009 年12 月在英国提起诉讼，希望免除将非欧盟航空公司纳入排放交易计划。此案已交由欧洲法院审理。航空运输协会提出的主要反对意见是该排放交易计划违反了《芝加哥公约》中的多项条约规定，尤其是第一条，该条规定各国对其领空内的航空公司拥有主权。“我们相信我们一定能胜诉，这一点无论怎样强调都不为过”，Pohle 表示，“我们希望此案能在今年排放交易计划生效前得以解决。” 国际民航组织英国代表Michael Rossell 指出，“我们所了解的信息是本案可能会在今年年底听证并在明年初宣判。” 各航空公司认为从经济角度看，排放交易计划毫无意义。“航空业是一个资金密集型行业，挪用购买新技术的资金以遵守排放交易计划的规定]风险很大”，拉美和加勒比地区航空运输协会执行干事Alex de Gunten 在生态航空大会上表示，“对欧洲人来说，这可能是个不错的体系。但请不要将其强加给其他地区。” 而Rossell 在为排放交易计划辩解时表示，“即使我们使用当今最高效的飞机，航空业的二氧化碳排放仍将继续增加。如果一个地区的排放量上升，则其他地区必须降低排放量……出于政策原因，欧洲地区决定采取行动监测排放量并鼓励航空承运人降低排放量。为实现这一目标，排放交易计划的成效最为显著。”
