继郑西高铁通车运营导致郑州至西安航线停飞后，3月27日起，南京至武汉航线也全部停飞。在沪宁汉动车开行的冲击下，相关线路航线急剧减少，沪汉日均航班也关闭近半，4月份目前可查最低票价仅为160元，加上燃油附加费后也不及动车二等座的票价。
动车开行后，武汉至合肥、南京、上海全程分别仅需2、3、5小时，其中武汉至南京缩短近8小时，原有的航空线路受到明显冲击，客源明显下降。目前，南京至武汉航班每天往返2趟，分别由云南祥鹏航空有限责任公司（Lucky Air co., Ltd.，简称“祥鹏航空”）、中国南方航空股份有限公司（China Southern Airlines Company Limited，简称“南航”）执飞，全价票为730元，日常上座率不及50%。尽管近两年两家航空公司甚至推出2折优惠机票，但由于两市机场离市中心很远，低票价已然没有吸引力，除节假日外，宁汉航班几乎班班亏损。而形成鲜明对比的是，宁汉动车二等座票仅180元，上座率几乎超90%。 与宁汉线相同的是，上海至武汉航线也逐渐减少。目前上海至武汉动车每天共开行22趟，其中最短间隔仅10分钟，二等座票价为274元。而上海至武汉经济舱机票全价810元，高峰时段仅有7-9折。 公路客运班次也在加剧萎缩，南京到武汉的大巴已由高峰时的每天20余班减至3班，上座率仍不足一成。
